游戏从一座摩天大楼中的神秘事件开始，这座位于美国某大城市的摩天大楼正遭到不明物体的占领，而之前派出的三角洲特种部队进入楼内之后就与外界失去联系。作为“F.E.A.R.”一员的玩家搭乘黑鹰直升机降落到大楼的楼顶，而飞机刚刚降落时就遭到了不明火力的压制。进入楼内后发现里面已经不满了超自然生物体。

　　游戏主角也有一些超能力，比如减缓时间流逝，子弹的运行速度减慢，这让人想起《黑客帝国》。开发团队Monolith Prod还搞了一些小花样，比如当你的手榴弹在时间减慢的条件下爆炸，你将会看到手榴弹像一堆奇异的泡沫在扩展。