每一部无尽的《无尽的黑暗》的游戏都有独立的故事情节，但也有着共同的线索把它们串联在一起，本作也不例外，在前作《无尽的黑暗：超越神的眼睛》中，玩家被带到了Shadowcrest的一个小镇上，与阿卡利尔斯之眼（the Eye of Acareous）带来的诅咒进行了战斗。这次黑暗的力量再次降临到了那里，一本神秘的书在这个小镇中吉普赛人的宝物中被发现了。或许这是一本不该被翻开的书，一本描绘通向死亡之岛的道路的书。

　　在迷雾与传说的笼罩中，有一个关于这个岛的传奇故事，据说岛上居住着奇怪的幽灵，隐藏着死灵族的生物。它们以那些胆敢从黑暗的海岸边上岸的愚蠢水手为食。虽然流传着岛上有大笔财宝的故事，但也有传言说岛上有着一股巨大的黑暗力量的源头，隐藏在岛上一座几百年前建造的古代神庙之中。

　　你在黑暗科学与艺术方面的经验再次有了用武之地，这些将揭开这“无尽的黑暗”的真正起源。